کمیته نصاب از کمیته‌های مهم و اساسی پوهنتون بوده که مطابق لایحه وظایف، زیرمجموعه معاونیت علمی ‌می‌باشد. وظایف اساسی و اصلی کمیته ترتیب، ارزیابی، توسعه و به‌روزرسانی نصاب و مفردات درسی مطابق نورم و استندردهای جهانی و نیاز بازار کار می‌باشد. هم‌چُنین بررسی محتوایی درس‌نامه‌ها، مشخص ساختن تعداد کریدت مضامین و سهم آن در برنامه و طول دوره تحصیلی مد نظر، از وظایف کمیته نصاب می‌باشد. 

کمیته تحقیقات از کمیته‌های تحت اثر معاونیت‌ علمی بوده و وظایف اساسی آن عبارت از ترتیب و تنظیم تمام برنامه‌های تحقیقات علمی در سطح پوهنتون می‌باشد. این کمیته در زمینه ترویج، حمایت، ارتقا ظرفیت و کنترول بر تمامی فعالیت‌های محققین نهاد فعالیت نموده، فراهم‌کننده تسهیلات و شرایط، مانند منابع، مراجع و مآخذ علمی برای محققان و حمایت، نشر و تکثیر تحقیقات علمی در سطح پوهنتون می‌باشد.

این کمیته در سطح نهاد اصولاً تحت اثر دفتر ریاست پوهنتون می‌باشد؛ ولی بر اساس عرف حاکم در پوهنتون‌ها، مربوط به معاونیت امورمحصلان است. عمده وظایف این کمیته تامین، حفظ و تحکیم نظم و قانون در نهاد بوده، بر عمل‌کردهای محصلان و منسوبان  پوهنتون نظارت و کنترول دارد. کمیته نظم و دسپلین بر اساس وظایف و صلاحیت‌ها، مجری و حافظ اصول، مقررات و ضوابط حاکم در نهاد بوده و با استناد به مواد قانونی اصول حاکم، وظیفه دارد تا با متخلفین برخورد قانونی نماید. 

کمیته فرهنگی که جهت تقویت و نهادینه نمودن ارزش‌های فرهنگی، دینی و اخلاقی و برنامه‌ریزی‌های فرهنگی اجتماعی نهاد فعالیت دارد، به‌طور کلی فعالیت‌های آن، تمام پوهنتون را پوشش می‌دهد؛ ولی از نظر ساختار مدیریتی در پوهنتون عاطفی، فعالیت‌های خویش را تحت نظر معاونیت علمی انجام می‌دهد. کمیته فرهنگی با گسترش فرهنگ اصیل اسلامی و ارزش‌های اخلاقی و مسلکی در نهاد، اجرای برنامه‌های فرهنگی، ورزشی، توسعه آگاهی و مشارکت فعال اعضای سازمان به اهداف فرهنگی مشخصی مانند: حفظ و احیا آثار ملی و اسلامی، مقابله با تهاجم فرهنگی و تربیت نیروهای متعهد و متخصص فعالیت می‌نماید.

وظایف اساسی این کمیته عبارت است از: ترویج فرهنگ استفاده از آموزش الکترونیک در سطح پوهنتون، گسترش امکانات و تجهیزات آموزش الکترونیکی در سطح نهاد، نظارت و ارزیابی از برگزاری صنوف آموزش الکترونیک در سیستم­های آموزش آنلاین وزارت تحصیلات عالی. هدف اساسی کمیته آموزش الکترونیک در پوهنتون، ترسیم کارشیوه‌ی استفاده بهینه از ابزارهای الکترونیکی جهت توسعه، بهبود و گسترش آموزش های الکترونیکی با استفاده فناوری‌ها و ابزارهای الکترونیکی به منظور پیاده‌سازی پروژه‌های کاربردی در زمینه آموزش الکترونیک است. 

جهت ایجاد، حفظ و ارتقا کیفیت و استندردهای پوهنتون‌های معیاری، وجود و فعالیت کمیته تضمین کیفیت در نهادهای تحصیلات‌عالی الزامی و حیاتی است. کمیته ارتقای کیفیت پوهنتون عاطفی بر اساس لایحه وظایف تحت اثر معاونیت علمی نهاد فعالیت نموده و مکلفیت‌های آتی را بدوش دارد: طرح و ترتیب فارمت‌های اعتباردهی نظر به معیارهای ملی وبین‌المللی، تحلیل گزارشات کاشناسان و شناسایی موانع و مشکلات در رابطه به تطبیق اعتباردهی برنامه‌های علمی در پوهنتون، ارائه مشوره در امر ایجاد میکانیزم و طرزالعمل‌های تهیه ارزیابی خودی و سایر مراحل اعتباردهی در پوهنتون.

کمیته تضمین کیفیت به هدف سازماندهی برنامه‌های تضمین کیفیت و اعتباردهی، مطابق با مقرره تضمین کیفیت، معیارات اعتباردهی و سایر اسناد تقنینی مربوط، برای اجرای اعتباردهی نهاد تحصیلی مربوطه در پوهنتون عاطفی فعالیت می‌نماید.

مطابق تعریف رایج پلان استراتیژیک: «سند راهبردی یا نقشه‌ی راه برای دستیابی به اهداف بلندمدت یک سازمان در یک بازه‌ی زمانی مشخص»، وظایف و هدف کمیته استراتیژیک پوهنتون عاطفی این‌است تا در هم‌آهنگی و همکاری با هیئت امنا و موسسین پوهنتون در زمینه ترتیب، تدوین و نظارت پلان‌ استراتیژیک و نیز پلان عملیاتی یا تطبیقی آن اقدام نماید تا از طریق ترتیب و تدوین پلان جامع و کامل برای رسیدن به اهداف کلان پوهنتون با چشم‌داست دیگاه، مأموریت، اصول و ارزش‌ها، اهداف اساسی، استراتژی‌های اصلی و سنجش پیشرفت پوهنتون در آن به صورت واقیعی و دست‌یافتنی تبیین شود. 

وظایف و اهداف اساسی و بنیادی کمیته دعوت و ارشاد پوهنتون‌عاطفی با چشم‌داشت این‌که الحمدلله کشور عزیز ما افغاستان یک کشور اسلامی و دارای ملت و نظام اسلامی می‌باشد و شهروندان این سرزمین همه مسلمان و معتقد به باورهای دینی و اسلامی می‌باشند، این است تا از طریق این کمیته در ترویج اصول و اساسات دینی، مبارزه با مفاسد اعتقادی، اخلاقی و اجتماعی و نیز ارتقای فرهنگ و آموزه‌های اسلامی در جامعه با طرح و تطبیق برنامه‌های منظم اقدامات عملی نماید. وظایف و پلان کمیته دعوت و ارشاد پوهنتون‌عاطفی شامل برگزاری دوره‌های آموزشی در ترویج و تعمیق باورهای دینی، افزایش فهم درست قرآن کریم وسنت نبوی(ص) در میان منسوبان پوهنتون، دوری و پرهیز از منکرات، مفاسد اخلاقی، و به‌خصوص پرهیز از مواد مخدر و اعتیاد، ترویج سنت‌های نبوی (ص) در رفتار، گفتار و کردار و روشن ساختن اذهان تمام پرسنل شامل استادان، محصلان، کارمندان و کارکنان از مسایل و ارزش‌های اسلامی می‌باشد.